La corriente del golfo, a lo largo de la costa norte de Cuba, hace de Cayo Coco y Cayo Guillermo una excelente zona para la pesca de altura también. Se pescan Agujas, Casteros, Atunes y Dorados entre otras especies.
Existen varias excursiones de pesca que se pueden reservar en los hoteles de estos cayos que incluyen la transportacion a las marinas, las embarcaciones y los equipos de pesca, la tripulación especializada, bebidas y alimentos.
El Torneo Internacional Marlin Ernest Hemingway se lleva a cabo en Cayo Guillermo.